MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187114	CCA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246442
2	NT_187114	AGC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246442
3	NT_187114	TGG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246442
4	NT_187114	AGG	2	6	599	604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246442
5	NT_187114	GAAAA	2	10	611	620	80 %	0 %	20 %	0 %	409246442
6	NT_187114	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246442
7	NT_187114	TGAC	2	8	668	675	25 %	25 %	25 %	25 %	409246442
8	NT_187114	TCG	2	6	689	694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246442
9	NT_187114	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246442
10	NT_187114	GC	3	6	869	874	0 %	0 %	50 %	50 %	409246442
11	NT_187114	CGG	2	6	975	980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246442
12	NT_187114	GAA	2	6	991	996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246442
13	NT_187114	TGG	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246442
14	NT_187114	TCT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246442
15	NT_187114	TGG	2	6	1058	1063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246442
16	NT_187114	ATC	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246442
17	NT_187114	GCC	2	6	1167	1172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246442
18	NT_187114	CCA	2	6	1236	1241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246442
19	NT_187114	GGC	2	6	1243	1248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246442
20	NT_187114	ATT	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246442
21	NT_187114	AGC	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246442
22	NT_187114	CG	3	6	1414	1419	0 %	0 %	50 %	50 %	409246442
23	NT_187114	AGG	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246442
24	NT_187114	CGG	2	6	1445	1450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246442
25	NT_187114	GGC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246442
26	NT_187114	CCGA	2	8	1471	1478	25 %	0 %	25 %	50 %	409246442
27	NT_187114	A	7	7	1485	1491	100 %	0 %	0 %	0 %	409246442
28	NT_187114	TGC	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246442
29	NT_187114	GT	3	6	1656	1661	0 %	50 %	50 %	0 %	409246443
30	NT_187114	CAT	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246443
31	NT_187114	CGC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
32	NT_187114	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246443
33	NT_187114	CTG	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
34	NT_187114	TACGT	2	10	1892	1901	20 %	40 %	20 %	20 %	409246443
35	NT_187114	AC	3	6	2003	2008	50 %	0 %	0 %	50 %	409246443
36	NT_187114	CCAT	2	8	2088	2095	25 %	25 %	0 %	50 %	409246443
37	NT_187114	GCC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
38	NT_187114	GC	3	6	2144	2149	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
39	NT_187114	GTG	2	6	2241	2246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246443
40	NT_187114	CTG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
41	NT_187114	GGC	2	6	2403	2408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
42	NT_187114	TGA	2	6	2416	2421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246443
43	NT_187114	CA	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	409246443
44	NT_187114	GGT	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246443
45	NT_187114	GC	3	6	2760	2765	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
46	NT_187114	CGG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
47	NT_187114	TCG	3	9	2849	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
48	NT_187114	GAC	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
49	NT_187114	CGC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
50	NT_187114	TCA	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246443
51	NT_187114	CGG	2	6	3047	3052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
52	NT_187114	CTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
53	NT_187114	ACC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246443
54	NT_187114	CGG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
55	NT_187114	TGC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
56	NT_187114	CGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
57	NT_187114	GATCG	2	10	3240	3249	20 %	20 %	40 %	20 %	409246443
58	NT_187114	CGT	2	6	3269	3274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
59	NT_187114	TCGC	2	8	3320	3327	0 %	25 %	25 %	50 %	409246443
60	NT_187114	TGA	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246443
61	NT_187114	GCG	2	6	3334	3339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
62	NT_187114	AAC	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246443
63	NT_187114	CAA	2	6	3388	3393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246443
64	NT_187114	CGA	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
65	NT_187114	CCG	2	6	3436	3441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
66	NT_187114	CG	3	6	3466	3471	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
67	NT_187114	GCT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
68	NT_187114	CGC	2	6	3560	3565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
69	NT_187114	CCG	2	6	3586	3591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
70	NT_187114	TGC	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
71	NT_187114	CGC	2	6	3737	3742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
72	NT_187114	CG	3	6	3744	3749	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
73	NT_187114	CCA	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246443
74	NT_187114	CGC	2	6	3938	3943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
75	NT_187114	CCG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
76	NT_187114	GCCT	2	8	4040	4047	0 %	25 %	25 %	50 %	409246443
77	NT_187114	GCC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
78	NT_187114	GCC	2	6	4260	4265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
79	NT_187114	GGC	2	6	4322	4327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
80	NT_187114	TTC	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246443
81	NT_187114	CAG	2	6	4365	4370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
82	NT_187114	GCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
83	NT_187114	TCC	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246443
84	NT_187114	GGC	2	6	4488	4493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
85	NT_187114	GC	3	6	4492	4497	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
86	NT_187114	A	6	6	4531	4536	100 %	0 %	0 %	0 %	409246443
87	NT_187114	CTCA	2	8	4559	4566	25 %	25 %	0 %	50 %	409246443
88	NT_187114	GGT	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246443
89	NT_187114	GCG	2	6	4606	4611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
90	NT_187114	GCT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
91	NT_187114	TCG	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
92	NT_187114	ATT	2	6	4754	4759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246443
93	NT_187114	CGA	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
94	NT_187114	CAG	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
95	NT_187114	CGG	2	6	4898	4903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246443
96	NT_187114	CG	4	8	4943	4950	0 %	0 %	50 %	50 %	409246443
97	NT_187114	CTG	2	6	4974	4979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
98	NT_187114	CGA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246443
99	NT_187114	GAG	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246443
100	NT_187114	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246443
101	NT_187114	TCG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246443
102	NT_187114	ACC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246443
103	NT_187114	CGC	2	6	5103	5108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246443
104	NT_187114	GCCC	2	8	5375	5382	0 %	0 %	25 %	75 %	409246444
105	NT_187114	CGC	2	6	5430	5435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246444
106	NT_187114	CTCG	2	8	5478	5485	0 %	25 %	25 %	50 %	409246444
107	NT_187114	GCC	2	6	5551	5556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246444
108	NT_187114	G	6	6	5567	5572	0 %	0 %	100 %	0 %	409246444
109	NT_187114	ATG	2	6	5623	5628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246444
110	NT_187114	CGCTT	2	10	5663	5672	0 %	40 %	20 %	40 %	409246444
111	NT_187114	AGG	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246444
112	NT_187114	AAC	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246444
113	NT_187114	GCC	2	6	6040	6045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246444
114	NT_187114	CGC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246444
115	NT_187114	ATA	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246444
116	NT_187114	CGG	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246444
117	NT_187114	CGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246444
118	NT_187114	CTG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246444
119	NT_187114	CGG	2	6	6208	6213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246444
120	NT_187114	CGG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246444
121	NT_187114	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246444
122	NT_187114	AG	3	6	6294	6299	50 %	0 %	50 %	0 %	409246444
123	NT_187114	TGG	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246444
124	NT_187114	CAACCG	2	12	6348	6359	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409246444
125	NT_187114	AGA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246444
126	NT_187114	CGTA	2	8	6429	6436	25 %	25 %	25 %	25 %	409246444
127	NT_187114	GC	3	6	6504	6509	0 %	0 %	50 %	50 %	409246444
128	NT_187114	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246444
129	NT_187114	TGG	2	6	6562	6567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246444
130	NT_187114	GC	3	6	6572	6577	0 %	0 %	50 %	50 %	409246444
131	NT_187114	CAA	2	6	6661	6666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246445
132	NT_187114	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	409246445
133	NT_187114	CAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246445
134	NT_187114	GCC	2	6	6857	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246445
135	NT_187114	CCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246445
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244	NT_187114	AAAG	2	8	14527	14534	75 %	0 %	25 %	0 %	409246450
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247	NT_187114	ATCA	2	8	15243	15250	50 %	25 %	0 %	25 %	409246452
248	NT_187114	CAA	2	6	15293	15298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246452
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251	NT_187114	GCG	2	6	15468	15473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246452
252	NT_187114	TAA	2	6	15489	15494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246452
253	NT_187114	CCA	2	6	15562	15567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246452
254	NT_187114	CGG	2	6	15577	15582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246452
255	NT_187114	ATC	3	9	15600	15608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246452
256	NT_187114	AG	3	6	15613	15618	50 %	0 %	50 %	0 %	409246452
257	NT_187114	GCT	2	6	15633	15638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246452
258	NT_187114	CAACC	2	10	15656	15665	40 %	0 %	0 %	60 %	409246452
259	NT_187114	TCA	2	6	15763	15768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246452
260	NT_187114	CGC	2	6	15808	15813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246452
261	NT_187114	GCC	2	6	15832	15837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246452
262	NT_187114	CAG	2	6	15878	15883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246452
263	NT_187114	A	7	7	15884	15890	100 %	0 %	0 %	0 %	409246452
264	NT_187114	CAA	2	6	15967	15972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246452
265	NT_187114	A	7	7	16015	16021	100 %	0 %	0 %	0 %	409246452
266	NT_187114	CTG	2	6	16049	16054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246452
267	NT_187114	TGA	2	6	16164	16169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246452
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269	NT_187114	AAGA	2	8	16214	16221	75 %	0 %	25 %	0 %	409246452
270	NT_187114	CGT	2	6	16239	16244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246452
271	NT_187114	ATT	2	6	16253	16258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246452
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273	NT_187114	CG	3	6	16650	16655	0 %	0 %	50 %	50 %	409246453
274	NT_187114	AGC	2	6	16816	16821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246453
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281	NT_187114	GCA	2	6	17146	17151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246453
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286	NT_187114	CAG	2	6	17300	17305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246453
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291	NT_187114	CGA	2	6	17536	17541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246453
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299	NT_187114	T	6	6	17874	17879	0 %	100 %	0 %	0 %	409246454
300	NT_187114	GCT	2	6	17954	17959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246454
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382	NT_187114	CTC	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246458
383	NT_187114	GC	3	6	22153	22158	0 %	0 %	50 %	50 %	409246458
384	NT_187114	GAT	2	6	22182	22187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246458
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386	NT_187114	CGG	2	6	22222	22227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246458
387	NT_187114	CGATG	2	10	22256	22265	20 %	20 %	40 %	20 %	409246458
388	NT_187114	CG	3	6	22280	22285	0 %	0 %	50 %	50 %	409246458
389	NT_187114	GAG	2	6	22374	22379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246458
390	NT_187114	TGA	3	9	22396	22404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246458
391	NT_187114	CGA	2	6	22409	22414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246458
392	NT_187114	GCT	3	9	22439	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246458
393	NT_187114	TGA	2	6	22454	22459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246458
394	NT_187114	T	6	6	22479	22484	0 %	100 %	0 %	0 %	409246458
395	NT_187114	GCGTC	2	10	22499	22508	0 %	20 %	40 %	40 %	409246458
396	NT_187114	GCG	2	6	22518	22523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246458
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399	NT_187114	GAA	2	6	22635	22640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246458
400	NT_187114	CTG	2	6	22722	22727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246458
401	NT_187114	CGC	2	6	22768	22773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246458
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403	NT_187114	CGG	3	9	22899	22907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246459
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411	NT_187114	GCG	2	6	23239	23244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246459
412	NT_187114	GGC	2	6	23362	23367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246459
413	NT_187114	ATC	2	6	23371	23376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246459
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415	NT_187114	TAT	2	6	23529	23534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246459
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431	NT_187114	TGA	2	6	24413	24418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246460
432	NT_187114	TGA	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246460
433	NT_187114	CGC	2	6	24501	24506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246460
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473	NT_187114	GC	4	8	26306	26313	0 %	0 %	50 %	50 %	409246461
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487	NT_187114	TGA	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246461
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489	NT_187114	ATCG	2	8	27110	27117	25 %	25 %	25 %	25 %	409246462
490	NT_187114	GGCC	2	8	27170	27177	0 %	0 %	50 %	50 %	409246462
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493	NT_187114	GCTG	2	8	27236	27243	0 %	25 %	50 %	25 %	409246462
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498	NT_187114	GGT	2	6	27621	27626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246462
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500	NT_187114	CCA	2	6	27754	27759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246462

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